Volgens die organisaties was die exploitatie namelijk in strijd met artikel 2.7 lid 2 van de voormalige Wet natuurbescherming (nu artikel 5.1 lid 1 onder e Omgevingswet), omdat die exploitatie leidde tot een toename van stikstofdepositie op al overbelaste Natura 2000-gebieden en daarvoor geen vergunning was verleend. In geschil was onder meer de uitleg en toepassing van het begrip ‘project’ in de zin van artikel 6 lid 3 van richtlijn 92/43/EEG (Habitatrichtlijn). De Raad van State heeft de uitspraak van de rechtbank en het besluit op bezwaar van gedeputeerde staten van Overijssel vernietigd.